Instalasi Bedah Sentral (IBS) RSUD Gema Santi Nusa Penida merupakan salah satu bagian dari sistem pelayanan kesehatan di Rumah Sakit, yang penting dalam hal memberikan pelayanan kepada pasien yang memerlukan tindakan pembedahan, baik untuk kasus-kasus bedah terencana (elektif) maupun untuk kasus-kasus bedah darurat/ segera (cito). 

Pada tanggal 14 Oktober 2019, untuk pertama kali di RSUD Gema Santi Nusa Penida dilaksanakan pelayanan IBS. Tahun 2021 pelayanan IBS sudah berjalan dengan baik. Dengan adanya pelayanan IBS di RSUD Gema Santi Nusa Penida dapat mengurangi rujukan pada pelayanan Bedah maupun pelayanan Kebidanan patologis di Nusa Penida.